（一）复查程序：复查工作分为企业自查，省、自治区、直辖市、计划单列市化工厅（局、公司）组织复查，化学工业部环保办公室核查三个阶段进行。
１．企业要按照清洁文明工厂六条标准认真进行自查，实事求是地写出书面自检材料，并填写《清洁文明工厂复查申请表》（见附件一）、《“三废”治理情况表》（见附件二）一并上报化工主管部门申请复查。
２．各省、自治区、直辖市、计划单列市化工厅（局、公司）负责组织对本地区的清洁文明工厂进行全面复查工作。复查结果分为三档，一是合格，二是基本合格需整改，三是不合格。填写《清洁文明工厂复查情况分类表》（见附件三）并写出复查总结材料，上述总结材料和表格连同企业填报的《清洁文明工厂复查申请表》、《“三废”治理情况表》及总结材料，原始监测数据一并上报化学工业部环保办公室核查。
３．化学工业部环保办公室对各地上报的清洁文明工厂复查材料进行核查，视具体情况，对部分特殊企业组织省、市化工部门相互交叉检查或抽查，对确实合格的企业，发给《清洁文明工厂合格证书》。基本合格但需整改的企业不发给合格证书，待整改完成后全部合格，再核发合格证书。
（二）复查内容
１．检查企业排放的主要污染源是否全部做到达标排放是检查的重点。必须对照《化工行业主要污染源治理要求表》所规定的内容，逐项进行现场检查，核对监测数据。有一个项目存在问题，不算合格。
２．对企业设备管道及生产现场进行全面检查。要求设备管道必须保持整洁，轴见光，设备见本色，沟见底，厂房、墙壁、窗户无积尘，生产现场见不到脏乱差现象。设备完好率在９５％以上、泄漏率在０．５％以下，在现场看不到地面有积水（不该积水的地方）、物料等。没有恶臭等异常气味。如发现有与上述要求不符之一者，不算合格。
３．检查“三废”综合利用。凡是国内同行业已综合利用的“三废”必须综合利用，不能利用的废渣必须妥善堆放，不造成二次污染。能利用的“三废”资源回收利用率达８０％以上，能利用和余热利用率达７７０％以上，生产用水（以可循环利用量计）循环利用率长江以北地区达６５％以上，其他地区５０％以上，对“三废”综合利用情况，检查时要核对生产统计台帐和销售财务帐目，以帐目所列实际数字为准，不能企业说个什么数字就认可。凡是综合利用达不到以上要求，不算合格。
４．检查车间厂房内外，厂区和生活区大气中的有害物质、粉尘浓度是否符合《工业企业设计卫生标准》，必须进行现场勘察，核地监测数据；检查车间和作业场所的噪声是否符合《工业噪音卫生标准》，必须在现场进行实测。车间和作业场所空气中有害物质的浓度应有９５％以上监测点达到国家工业卫生标准，９５％以上噪声监测点达到工业噪声卫生标准。职业中毒发病率控制在０．５％以下；消灭中毒死亡和多人中毒。达不到上述要求不算合格。
５．检查厂区环境，要求环境优美。厂前区和厂后区一个样，绿化面积（指可绿化面积）达７０％以上。马路清洁，空地平坦无垃极，堆放的产品、器材、包装空桶等物排列整齐。凡是上述要求有一项不符合要求，不算合格。
６．检查发现１９８９年发生重大环境污染事故的，年度内污染事故罚款合计在万元以上的，扰民严重的三类企业，应撤消清洁文明工厂称号。
７．环境管理机构必须健全。大中型企业应设环保处（科）和监测站（组），配备能适应开展工作的人员。其他化工企业也要配备适当的环保管理和环境监测人员。各项环境管理规章制度必须齐全，并能严格执行。所有环保装置能正常运转，与生产装置同时开、停车。企业在实行经济承包责任制中。对厂长任期有环保责任目标，并完成情况较好。
（三）复查“清洁文明工厂”的企业，有关“三废”治理排放的污染物是否达到规定的要求，除考核企业自行测定的数据外，还必须有化工系统二级环境监测站或地方环保部门测定的数据进行验证。验证监测数据是否可靠应与治理情况对应检查，避免弄虚作假。
（四）需要限期整改的企业，取长整改期限为１年。在整改期间内不得申请进入“六好企业”和国家级企业，并停止使用清洁文明工厂的称号。经过整改到期向化工主管部门申请验收，验收仍达不到要求的，取消清洁文明工厂称号。
（五）经复查取消清洁文明工厂称号的企业，若已获得“六好企业”或国家一、二级企业称号，要同时取消“六好企业”称号，并上报国家有关部门建议取消国家一、二级企业称号。
（六）“清洁文明工厂”复查工作由省、自治区、直辖市、计划单列市化工厅（局、公司）组织进行。
（七）各省、自治区、直辖市、计划单列市化工厅（局、公司）组织复查清洁文明工厂要由主管环保工作的厅（局）长亲自负责把关，指定精通环保业务、秉公办事、为政清廉的同志办理。在复查过程中，一定要坚持高标准，严要求，严格按部颁清洁文明工厂六条标准及实施细则和复查办法逐项检查，合格一个，通过一个。不得起过场，更不得以任何借口降低标准，搞突击验收或通过复查。
附件：一、清洁文明工厂复查申请表（略）
二、“三废”治理情况表（略）
三、清洁文明工厂复查情况分类表（略）
三、清洁文明工厂复查情况分类表（略）