工业冷水机有完善的安全保护装置，一般不会出现危险的事情。
首先，冷水机是水、电、压力三者结合的系统，使用时要特别小心，机器首先要可靠接地！时刻检查水位，注意不要让水溢出或飞溅到电器部分。冷水机最大的故障隐患就是系统冷媒漏，冷水机氟利昂系统压力大于大气压，接口众多，受机箱空间影响，内部管路走向崎岖蜿蜒，工艺口、毛细管等管径较小，这些问题都会增加系统破裂的风险。所以平时机器正常时，尽量不要去打开机箱，以免不小心碰漏了系统。
一般冷水机设计的冷冻水温在5—15度，所以用户尽量不要把水温设定到5度以下（导致制冷量下降、蒸发器表面结冰、压缩机表明结霜并长期运行而温度却不能下降）或15度以上，也有可以在25度长期运行的，但温度设置过高，会导致压缩机发烫、负荷过大、高压升高。无论如何，设置水温太高或太低，都会影响冷水的寿命，严重的会直接损坏机器或立即被保护电路保护停机。用户使用一段时间后，发觉制冷效果不如以前好了，首先请检查冷凝叶片间（风冷机）的缝隙是否被灰尘堵住（这种情况一般伴随着机器高压升高，可看高压表的压力指示，甚至高压保护停机），如堵住，用气枪清理即可，同时检查水箱的清洁度，蒸发器表面有水垢的要清理干净。如是水冷机，则要开启水冷凝器的水系统侧清洗水垢或泥浆，同样也要检查清理水箱和蒸发器，必须定期更换水箱里面的冷冻水，保持清洁。