（一）所有入库保健食品都必须进行外观质量检查，核实产品的包装、标签和说明书与批准的内容相符后，方准入库。
（二）仓库保管员应根据保健食品的储存要求，合理储存保健食品，需冷藏的保健食品储存于冷库（温度2-10℃），需阴凉、凉暗储存的储存于阴凉库（避光、温度不高于20℃），可常温储存的储存于常温库（温度0-30℃），各库房的相对湿度应保持在45-75%之间。
（三）保健食品应离地、隔墙放置，各堆垛间应留有一定的距离。搬运和堆垛应严格遵守保健食品外包装图示标志的要求规范操作，堆放保健食品必须牢固、整齐、不得倒置。对包装易变形或较重的保健食品，应适当控制堆放高度，并根据情况定期检查、翻垛。
（四）应保持库区、货架和出库保健食品的清洁卫生，定期进行清扫，做好防火、防潮、放热、防毒、防虫、防鼠和防污染等工作。
（五）应定期检查保健食品的储存条件，做好仓库的防晒、温湿度监测和管理。每日上下午各一次对库房的温湿度进行检查和记录，如温湿度超出范围，应及时采取调控措施。

（六）应根据库存保健食品的流转情况，定期检查保健食品的质量情况，发现质量问题应立即在该保健食品存放处放置“暂停发货”牌，并通知监管部门调查处理