1. 消毒供应中心工作人员工作时应严格遵守“标准预防”的原则：进入各工作区域要按规定更衣、更鞋、戴圆帽；去污区工作人员应加戴外科口罩，穿专用鞋，抗湿罩袍或围裙、戴橡胶手套或防刺穿乳胶手套，戴防护面罩或护目镜；去污区安置有洗眼装置。
2、手卫生防护：工作人员应严格掌握洗手及手消毒指征，做好自我防护工作。
3、锐利器械的防护：工作人员在进行器械分类时，注意力应集中，动作敏捷，锐利器械和普通器械应分开放置清洗，避免在清洗过程中误伤工作人员，同时防止利器相互碰撞，造成刃面受损。如不慎被锐利器械刺伤，应做好锐器伤应急处理。
4、物理因素的防护：消毒员在灭菌过程中应严格遵守操作规程，穿长袖工作服，戴清洁或灭菌的帆布手套进行灭菌物品的装载和卸载工作，另外科室的蒸汽管道应有保温防护，以免工作人员烫伤。工作人员在操作煮沸消毒器和干燥恒温箱时应严格遵守操作规程，必要时戴防烫手套；如不慎烫伤，科室配有烫伤膏予以紧急处理。
5、化学因素的防护：工作人员在使用和配制对皮肤有刺激的消毒液清洗剂、除锈剂时，必须戴手套、口罩、护目镜，必要时戴防护面罩。
6、免疫防护：消毒供应中心工作人员应每年进行输血前七项检查，根据化验结果及时进行疫苗接种并定期检查，提高机体的免疫力，防止院内感染的发生。