1.认识论
以危险和隐患作为研究对象，其理论的基础是对事故因果性的认识，以及对危险和隐患事件链过程的确认。建立了事件链的概念，有了事故系统的超前意识流和动态认识论。确认了人、机、环境、管理事故综合要素，主张工程技术硬手段与教育、管理软手段综合措施，提出超前防范和预先评价的概念和思路。

2.理论系统
由于研究对象和目标体系的转变，危险分析与风险控制理论发展了如下理论体系：
系统分析理论：ＦＴＡ故障树分析理论、ＥＴＡ事件树分析理论、ＳＣＬ安全检查表技术、ＦＭＦＡ故障及类型影响分析理论等。
安全评价理论：安全系统综合评价、安全模糊综合评价、安全灰色系统评价理论等。
风险分析理论：风险辨识理论、风险评价理论、风险控制理论。
系统可靠性理论：人机可靠性理论、系统可靠性理论等。
隐患控制理论：重大危险源理论、重大隐患控制理论、无隐患管理理论等。

3.方法和特征
由于有了对事故的超前认识，这一理论体系导致了比早期事故学理论更为有效的方法和对策，如预防型管理模式；危险分析、危险评价、危险控制的基本方法过程；推行安全预评价的系统安全工程；四负责的综合责任体制；管理中的“五同时”原则；企业安全生产的动态“四查工程”等科学检查制度等。危险分析与风险控制理论指导下的方法，其特征体现了超前预防、系统综合、主动对策等。
危险分析及隐患控制理论从事故的因果性出发，着眼于事故的前期事件的控制，对实现超前和预期型的安全对策，提高事故预防的效果有着显著的意义和作用。但是，这一层次的理论在安全科学理论体系上，还缺乏系统性、完整性和综合性。