1.沼气系统区域内严禁烟火，并在醒目位置设置“严禁烟火”标志；区域内必须配备灭火器，运行人员须熟练掌握灭火器使用方法区域内须装设可燃气体报警装置，发现问题应立即上报并处理。
2.区域内严禁违章明火作业，动火操作必须采取安全防护措施，并经过安全部门审批；沼气管道施工必须做出安全施工方案，并经安全部门审批和监督。
3.每天须定时对系统运行压力、气囊压力、水封罐水位、火炬燃烧情况进行巡检，巡检间隔不得超过两小时，发现异常应立即处理或者上报后处理。
4.系统各部位同时间的运行压力应保持一致，各部位压力差如超出1kpa应检查是否有堵塞（位置点为：脱硫罐压力表、沼气囊出口管路压力表、火炬压力表）。
5.气囊外膜设定运行压力为2kpa，如低于或者超出2kpa应检查恒压控制系统并及时恢复正常，如不能及时解决应立即变为手动控制，以保证气囊安全；内膜运行压力不得超出4kpa，应及时调整火炬进气阀；应定期排掉气囊内积存的凝水。
6.水封罐液位应保持在液位计100mm左右，上下不得超出50mm，如超出范围应及时补水或排水。
7.应定期排掉气液分离器内积存的凝水，排水时如有沼气冒出应立即关闭排水阀。
8.运行人员须定期对脱硫塔内的碱液进行检测，Ph值接近7时应立即切换到备用脱硫塔，并更换碱液，更换碱液时应配戴防护用具。