农药生产是职业危害严重的行业之一，由于生产的非连续性和工艺设备比较落后，加剧了这种情况。事故统计表明中毒、火灾、爆炸、是其主要危害。由于农药门类品种较多，生产过程所涉及的单元反应过程和单元操作过程十分广泛。凡化工单元反应如氯化、氧化、还原、硝化、氨化、磺化、歧化以及单元操作如反应操作、抽提、萃取、蒸馏、分离、冷凝、干燥等均有涉及，既有连续生产(如光气生产)，又多是间断性生产，加之，农药生产所用原料、中间体大都有毒易燃，所以具有较高的危险性。
 
　　【身体防护】生产过程易燃物质泄漏，尤其是气体和蒸气泄漏，可引起爆炸，如黄磷引燃温度很低，在空气中会自燃，一氧化碳、甲醇、乙醇、苯等都可与空气形成爆炸性混合物；中间体合成和农药合成过程中控制不当，会使反应失控或形成易分解爆炸的物质，引发化学爆炸，如三氯化磷生产中若氯过量会生成极易分解爆炸的五氯化磷，五氯化二磷、三氯硫磷、甲基或乙基氯化物、甲基或乙基硫化物等中间体的合成一旦失控，也会爆炸，烷基氯化物和硫化物自身就不稳定，易分解爆炸。
 
   
　　【呼吸防护】所有农药原料、中间体和成品大都有不同程度的毒性。生产过程中，急性中毒都由泄漏引起，有的则是检修失措或个人防护不当造成的。中毒类型可分为：有机磷类农药中毒、氨基甲酸酯类农药中毒、拟除虫菊酯类农药中毒、黄磷中毒、光气中毒、甲基异氰酸酯中毒，为防止中毒现象发生，作业时佩带防毒装备是必须的。
   
　　【手部防护】就农药而言,它对人体的危害是十分的严重的,农药主要由三条途径进入人体内：一是偶然大量接触，如误食；二是长期接触一定量的农药，如农药厂的工人和使用者农民；三是日常生活接触环境和食品中的残留农药，由此可见长期接触或有农药，可使农药在体内不断蓄积，对人体健康构成潜在威胁,必须与农药做好绝缘措施。